Наша больница была организована как самостоятельное лечебное учреждение 15 декабря 1950 г. на базе детского отделения городской больницы №4 в здании бывшего тубдиспансера и была рассчитана на 30 коек. Главным врачом была назначена Сергеева Полина Филипповна.

В составе больницы была детская консультация на 4 педиатрических участка, заведовала которой врач Барская Р.М. Кроме главного врача и заведующей консультации работали еще 2 врача Тубасова А.Н., Субачева А.М. и 13 медсестер. Этот маленький коллектив осуществлял весь объем лечебной и профилактической работы детского населения старого города.

С 1951 до 1954 г. коечный фонд расширился до 150 коек.
С 1962 г. больницу возглавила Зимовец Татьяна Ивановна. А в 1963 г. больница перешла в типовое здание и коечный фонд расширился до 320 коек. 
С 1967 г. больница стала базой госпитальной педиатрии.

13 декабря 1985 г. больница перешла в новое типовое здание с коечным фондом 305 коек. Главным врачом был назначен Гуранский Станислав Владимирович. 
С 1986 г. по май месяц 1994 г. главным врачом Детской больницы №3 назначается Голик Василий Васильевич. В состав больницы входило три поликлиники.
С мая месяца 1994 г. по август 1996г. главным врачом Детской больницы №3 назначается врач высшей категории Тельжанова Фатима Абдыгаликовна. Детская больница №3 обслуживала детское население Октябрьского района и расположенные рядом сельские районы.

В связи с реорганизацией и преобразованием в РМО,  больница была присоединена к городской клинической больнице №4, которую возглавлял главный врач Черенков П.Ф.

С 1997 г. Детская больница № 3 была отделена от городской клинической больницы №4 и преобразована в Детский стационар №3.  С января 1997 г. по май 2014 г. директором был Каменев Вадим Валентинович.

В 2007 г. Детский стационар №3  был переименован в Детскую больницу г.Караганды и развернут на 166 коек.

В настоящее время директором больницы является Омирзакова Перизат Ахметовна.
Детская больница г. Караганды является клинической базой кафедры детских болезней КГМА, факультета повышения квалификации КГМА, медицинского колледжа.